Olá, bom dia!
Entendo que pode ter duas formas:
Se ele tiver contabilidade mensal, então ele vai fazer a contabilidade de fato, considerando as receitas e as despesas / custos.
Mas se ele não tiver contabilidade mensal, entendo que ele teria que considerar o faturamento total, se esse valor passa pela conta dele.
Acredito que dessa forma, consegue evitar possível fiscalização da RFB.
Espero ter ajudado.