Olá, bom dia!
Apenas pelo que foi exposto na pergunta, não conseguimos te afirmar se ela tem a dívida ativa ou não.
O correto, seria de fato fazer uma consulta a fundo, tanto na PGFN, quanto na certidão de pendências da Receita Federal, que são os locais corretos.
Lembre-se de fazer a consulta no perfil de PF e também do CNPJ, pois alguns casos de Dívida Ativa, o sistema joga ela para a PF.
Se de fato fez a consulta pelo relatório de pendências, e também pelo regularize, e não consta nenhuma dívida, então de fato não existe. Seria interessante baixar e guardar esse relatório das pendências para te garantir.
Um outro meio de descobrir o tipo de parcelamento feito lá no Sebrae, é solicitar a cliente a guia da primeira parcela que pagou. Nela vai constar o tipo de débito que ela pagou.
Espero ter ajudado.