Olá, boa noite!
Particularmente, não tenho conhecimento de mudanças. Por aqui tudo normal.
Seria interessante verificar se de fato o cliente pagou a guia correta, e solicitar o comprovante para verificar se bate com o boleto emitido.
Normalmente o parcelamento é rescindido quando não paga a primeira parcela, ou quando de fato há parcelas vencidas.
Por isso seria interessante investigar mais a fundo o seu caso, e se for necessário, abrir um chamado na PGFN.
Espero ter ajudado.