Olá Maria, tudo bem?
Não há impedimento legal para empréstimos pelo fato de o CNPJ ter ficado inapto, desde que hoje esteja regular. Em termos financeiros, é mais vantajoso manter a empresa ativa, pois já possui histórico. A abertura de um novo CNPJ só seria indicada se houver necessidade específica, sendo geralmente mais interessante apenas ajustar o enquadramento da empresa atual conforme a nova atividade.
Espero ter ajudado.