Olá Nicole, tudo bem?
Nesse caso, eu faria nessa ordem:
1. Verificar a situação do CNPJ
Confirme se ele foi só desenquadrado do SIMEI ou se houve baixa/inaptidão também.
2. Entregar as declarações em atraso
Regularize primeiro as DASN-SIMEI pendentes (2025 e 2026, se já disponível/obrigatória no período consultado).
3. Levantar os débitos
Depois consulte os DAS em aberto, dívida ativa e parcelamentos para identificar o que ainda pode ser pago normalmente e o que já foi inscrito.
4. Regularizar os pagamentos/parcelamento
DAS em aberto: emitir e pagar;
Dívida ativa: negociar pela Procuradoria-Geral da Fazenda Nacional;
Parcelamento: verificar se está ativo ou rescindido.
Fazendo nessa sequência costuma ficar mais fácil visualizar o que realmente está pendente e evitar pagar algo em duplicidade.
Espero ter ajudado.