Olá João Marcos, tudo bem?
De acordo com a orientação no gov.br:
- Servidor Público Federal não pode ser MEI, com base na Lei nº 8112/90. Servidor Públicos Estadual e Municipal deve observar os critérios da respectiva legislação/estatuto do servidor.
https://www.gov.br/empresas-e-negocios/pt-br/empreendedor/quero-ser-mei/o-que-voce-precisa-saber-antes-de-se-tornar-um-mei
Neste caso seu cliente, vai precisar verificar diretamente no município se há algo que impeça a abertura desse MEI pelo cargo que ele exerce.
Espero ter ajudado!