Olá Fabiola
No relatório fiscal consta quais declarações estão em aberto? Pois com essas pendências em aberto não seria possível o CNPJ Ativo.
Emite o relatório fiscal e veja se existe alguma declaração em aberto, pois para solicitar o parcelamento foi preciso enviar as declarações. Pode ser que ao regularizar não foi aberta as intimações.
Espero ter ajudado.