Olá Filipe, tudo bem?
A venda para empresas, por si só, não obriga a inclusão de um CNAE de atacado. O que deve ser analisado é se a forma como o cliente realiza as vendas se enquadra como varejo ou atacado, conforme a descrição do CNAE.
O comércio varejista é caracterizado pela venda direta ao consumidor final, seja pessoa física ou jurídica, geralmente em pequenas quantidades. Já o comércio atacadista envolve vendas em maiores volumes.
Portanto, se o cliente vende frutas em pequenas quantidades, o CNAE de varejo pode ser suficiente. Mas, se ele vende em grandes volumes e para revenda, o correto seria incluir também um CNAE de atacado.
Então, se o CNAE atual reflete corretamente a operação, não há problema. Mas se houver indícios de atividade atacadista, é mais seguro ajustar o cadastro da empresa.
Espero ter ajudado!