Olá Viviana
Para um médico recém-formado que prestará serviços para clínicas e hospitais, o regime do Simples Nacional costuma ser o mais vantajoso no início da atividade, especialmente quando ele não tem funcionários, Faturara até R$ 20.000,00 a R$ 30.000,00 por mês e se optar pela tributação pelo Anexo III do Simples Nacional, com possibilidade de alíquota inicial de 6%, desde que não tenha folha de pagamento zero, conforme o fator R.
A prestação de serviços contábeis para abertura de CNPJ gira em torno de 800 a 1.500, isso depende de cada profissional e do preço praticado em sua região.
Para contabilidade de médico prestador de serviços (sem funcionário, no Simples Nacional):
Honorários mensais médios no mercado: R$ 400,00 a R$ 800,00, variando conforme faturamento médio mensal, quantidade de notas fiscais e/ou complexidade tributária.
Espero ter ajudado.