Olá Luciana, tudo bem?
Geralmente cada escritório implementa sua rotina, quanto a ordem de lançamentos.
Particularmente, eu iniciaria pelo fiscal, departamento pessoal e por fim, movimento financeiro (extrato bancário).
Quanto onde lançar os pagamentos, dependerá do que está sendo pago. Precisa analisar cada pagamento. Tarifa bancária por exemplo, é na conta de resultado de despesa com tarifas.
Indicaria que assista nossos cursos abaixo sobre o contábil par te auxiliar melhor:
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Espero ter ajudado!