Olá Thayna
Para trabalhadores autônomos, isso vale para Contadores, tem duas opções de recolhimento dos impostos:
1. Através do RPA - onde o autônomo presta serviço para PJ, ela fica responsável de reter e pagar os impostos devidos (INSS/IR).
2. Através de Emissão de NFSE - Nesse caso, o autônomo precisa ser registrado junto a prefeitura do município como autônomo.
Diante do que você mencionou, recomendo que realize o cadastro na Prefeitura de sua cidade, solicite o credenciamento para emissão da NFSE e na prestação dos seus serviços, emite a Nota aos seus clientes, e esses rendimentos você leva para o carnê leão para a apuração do IR. O INSS você recolhe sobre a alíquota de 20% sobre o salário mínimo ou o teto da previdência, esse valor você pode optar.
Espero ter ajudado.