Olá! Bom dia.
Você consegue sim ter o MEI para diversos serviços e atuar como Contadora PF, para isso precisa ir na prefeitura e fazer seu cadastro como autônoma.
As normas alteram de municipio para municipio.
É muito importante que você tenha um bom controle dos faturamentos para que possa provar caso necessário que os serviços são individuais.
Como autônoma é necessário que faça o RPA nas empresas em que faz contabilidade, para que tenha o recolhimento de INSS e de IRPF caso seja necessário.
Espero ter ajudado.