Olá Julio,boa tarde;
Embora não haja uma homologação oficial para o Windows 11, é possível que o PJe-Calc Cidadão funcione corretamente, já que o Windows 11 mantém compatibilidade com muitos aplicativos desenvolvidos para o Windows 10.
Você já conseguiu concluir o download e atualizar as tabelas, o que é um bom sinal. Recomendo testar as principais funcionalidades do programa para verificar se tudo está operando conforme esperado.
espero ter ajudado