Olá!
Não consigo entender sua dúvida. Este balanço veio de outra contabilidade?
Ou os saldos que consta a diferença, foi do exercício anterior?
Para ajudar, preciso saber o nome da conta. Se tem diferença, é necessário avaliar onde consta essa diferença.
Você tem opção de entrar em contato com seu sistema e ajudar à encontrar a diferença. Geralmente no sistema domínio, vem apresentando essa falha.