Contabilidade para MEI

Boa noite Pessoal,

Estou trabalhando com uma empresa do MEI neste ano. Ano passado ela teve um faturamento razoável. Realizei a proposta de realizar a contabilidade para ela conseguir isentar a distribuição de lucros. Mas quando comecei a conversar com ela., Ela não colocava nada de documento no CNPJ, apenas na pessoa Física. Neste caso eu conseguiria realizar a contabilidade apenas com faturamento em notas que ela teve, pró-labore e boleto DAS pago mensal? Mas já aconselhei que neste ano ela realizasse esse ajuste, o que tiver de despesa para a empresa ele pedisse nota fiscal para comprovar.;