Olá Matheus, boa tarde,
O IRRF deve ser registrado no momento do pagamento da guia, independentemente do período de apuração.
Um exemplo:
Registro do Desconto na Folha de Pagamento (Competência)
Data: 31/01/2024
D: Despesas com Salários (R$354,87)
C: IRRF a Recolher (R$354,87)
Pagamento da Guia do IRRF (Caixa)
Data: 20/03/2024
D: IRRF a Recolher (R$354,87)
C: Caixa/Banco (R$354,87)
Espero ter ajudado