Olá Maxwell
Se ele atua como intermediador (agência), deve emitir nota apenas sobre a comissão que recebe, e não sobre o valor total do pacote.
Exemplo: pacote de R$ 3.000,00 e comissão de R$ 300,00, a nota será de R$ 300,00, pois essa é a receita dele.
Agora, se ele compra e revende por conta própria, assumindo o risco da operação, então deve emitir nota sobre R$ 3.000,00 (valor total).
Para comprovar a comissão à Receita, é essencial ter contrato de intermediação, relatório de comissões e comprovante do valor recebido em conta.
Espero ter ajudado.