Olá, boa tarde!
Normalmente, é necessário entrar em contato por meio dos canais disponíveis no site do portal de serviços, por meio de e-mail, ou telefone.
Dessa forma, será orientado como proceder para a baixa dos documentos.
Vele lembrar, que caso queira apenas os XML das notas fiscais emitidas, é possível solicitá-los diretamente ao cliente, para que busque junto ao sistema emissor, que disponibiliza esses arquivos. Esse é um caminho mais curto, e menos demorado.
Espero ter ajudado.