Olá, boa noite!
Bom, temos um problema aí… Se ele exerce uma atividade com a empresa, mas ela não possui essa atividade legalizada, teoricamente ele não estaria dentro das regras fiscais vigentes.
Por conta disso, fica difícil dizer qual o melhor caminho, visto que há esse problema. Se ele só tem a atividade de administração, teoricamente seria considerado tudo como receita proveniente desta atividade. Porém, na prática, não é isso que ocorre, visto que ele tem essa outra atividade.
Sugiro aconselhar o cliente, e fazer as devidas alterações, para evitar problemas com o Fisco.
Espero ter ajudado.