Olá Elias, tudo bem?
O mais correto é emitir uma nota fiscal por paciente, por mês, correspondente ao valor efetivamente recebido (no seu exemplo, R$80/mês).
Alguns profissionais tentam agrupar notas ou adotar outros meios para reduzir o volume de emissões, mas é importante lembrar que isso pode ser interpretado como omissão ou confusão de receitas, o que gera risco fiscal, fora que se o paciente informa que pagou tal valor a clínica na declaração do imposto de renda pessoa física e a clínica não infomar que recebeu o x valor daquele determinado paciente, isso dará malha fina.
O que pode ser feito para otimizar é usar um sistema de emissão automática ou uma plataforma integrada que facilite esse processo. Você pode pesquisar por sistema que possam auxiliar nisso, como o Bling por exemplo, que é integrado com algumas prefeituras.
Espero ter ajudado!