Olá Osvaldo
Sim, há previsão de que o regime de ISS Fixo será extinto com a implementação plena da Reforma Tributária, de modo que o critério de ISS fixo deixará de existir, inclusive para autônomos, quando entrar o novo modelo de Imposto sobre Bens e Serviços (IBS).
A tributação de serviços, inclusive os prestados por autônomos, deverá ser feita via IBS ou conforme regras específicas definidas para esse novo tributo pelos estados e municípios.
Espero ter ajudado.