Olá Ana Caroline, tudo bem?
O Recibo do Receita Saúde deve ser utilizado por profissionais que atuam de forma autônoma, utilizando o CPF. Já para aqueles que possuem CNPJ, é a emissão da Nota Fiscal de Serviços Prestados que é obrigatória.
Neste caso, como ela atua com o CPF, apenas a emissão do Recibo do Receita Saúde já é suficiente. Não é necessário ter CNPJ para essa finalidade.
Espero ter ajudado!