Olá Lorrainy
Você está certa, para empresas optantes pelo Simples Nacional, não há obrigatoriedade legal de autenticação do Livro Registro de Entradas (nem mesmo do Livro Registro de Saídas), salvo se houver exigência específica de algum órgão estadual. Por isso, verifique a legislação Estadual.
O antigo contador provavelmente fazia a autenticação, por obrigação se o Estado exige, ou por zelo documental. Outra alternativa pode ser por inércia de processos antigos, ou para dar uma aparência de formalidade aos clientes e fiscalizações. Mas isso, só ele para dizer.
Espero ter ajudado.