Olá Valderi
O erro que você está recebendo provavelmente ocorre porque o sistema ainda reconhece a empresa como MEI. Você pode tentar as seguintes opções:
Aguardar alguns dias para que o sistema atualize o status da empresa.
Entrar em contato com a Junta Comercial para orientações específicas sobre como proceder nessa situação.
Aguardar a data da efetivação do desenquadramento.
Espero ter ajudado.