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Boa tarde, Dayane!
Sim, isso pode acontecer. Em alguns casos, o resultado é publicado no Diário Oficial da União (DOU), enquanto o sistema da FGV ainda está sendo atualizado e pode continuar exibindo informações como "recurso em análise" por um período.
Recomendo acompanhar tanto o portal da FGV quanto as publicações oficiais. Caso a divergência permaneça por vários dias, o ideal é entrar em contato diretamente com a banca para obter uma confirmação sobre a situação do recurso.