Olá Ester, tudo bem?
Você consegue sim fazer o lançamento das férias retroativamente, mas para isso é necessário reabrir as folhas de pagamento das competências em que as férias deveriam ter sido lançadas. Depois, registre as férias corretamente, recalcule a folha e faça o fechamento novamente. Nas competências em que houver o lançamento, o sistema vai gerar as diferenças de encargos (INSS e FGTS) que ficaram em aberto, e esses valores precisarão ser quitados com os acréscimos legais calculados automaticamente pelo sistema.
Espero ter ajudado.