Olá Ana Maria, tudo bem?
Se você der baixa no registro, os débitos de FGTS continuarão gerados no sistema, pois o histórico permanece. O procedimento correto é excluir os registros enviados no e-Social com o código errado, corrigir o código para 722 e reenviar os eventos com as informações corretas, para que o sistema exclua a cobrança indevida.
Caso algum valor de FGTS já tenha sido pago com base no código errado, será necessário solicitar o estorno para regularizar a situação.
Espero ter ajudado.