Boa tarde Alexandre, como vai?
Temos algumas aulas que podem te auxiliar.
Se você precisa proceder com o desenquadramento, a depender do estado, o sistema varia caso a caso. Você precisa identificar o sistema utilizado, para saber como proceder adequadamente.
Segue o link de algumas aulas:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/239569-abertura-alteracao-e-baixa-de-empresas-vre
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/89889-abertura-alteracao-e-baixa-de-empresas-rede-simples
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/105685-abertura-alteracao-e-baixa-de-empresas-regin
Caso a sua dúvida seja de fato uma atualização na Junta Comercial, precisa verificar o que de fato precisa. Normalmente, a Junta fornece um sistema de contato, onde pode tirar dúvidas, e verificar o melhor caminho também, conforme o caso, visto que há particularidades de acordo com o estado referente.
Espero ter ajudado.