Boa noite Luciane!
O correto, se você conseguir, seria cancelar a nota, e fazer uma nova acrescentando as informações corretas.
Se porventura você não conseguir mais fazer o cancelamento, seria necessário verificar a possibilidade de fazer uma nota fiscal complementar ou substituição da nota feita anteriormente.
Esse seria o caminho mais adequado.
Mas de qualquer forma, quando proceder com a apuração, você vai pagar o imposto devido de forma líquida, ou seja, vai apurar e descontar o valor que foi retido desses tributos, não ocorrendo a “bitributação”.
Espero ter ajudado.