Boa noite!
O DIFAL é calculado e recolhido com base no que foi efetivamente vendido a consumidores finais no trajeto, e não sobre a quantidade inicial da nota de remessa.
Temos algumas aulas que podem te auxiliar:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/215269-contabilidade-para-e-commerce/4413384-difal
Espero ter ajudado.