Olá Maryana
Nesses casos de intimação, precisa verificar a dívida que está na Receita Federal e na PGFN.
No Portal do Simples Nacional é feito o parcelamento dos débitos constante na base da Receita Federal, enquanto no Regularize é os débitos que não está mais na Receita Federal e foi transferido para a PGFN.
Por isso, sempre verifique se existe débitos também na PGFN, existindo, será dois parcelamentos, uma na Receita Federal e outro na PGFN.
Espero ter ajudado.