Recomendo que você entre em contato diretamente com a SEFAZ (eu vi que você citou que solicitou na junta comercial, mas normalmente a inscrição estadual solicitamos na Sefaz, não sei se no seu estado tem alguma particularidade), seja por e-mail ou telefone, para entender melhor o motivo do indeferimento. Muitas vezes, pode ser algo que apenas eles conseguem esclarecer com precisão.
Espero ter te ajudado!
