Olá Ediane, tudo bem?
Não é necessário dar baixa no CNPJ para abrir outro. O procedimento adequado é alterar o enquadramento do CNPJ existente para Microempresa (ME).
A ausência de local fixo não impede o enquadramento como ME. É suficiente informar um endereço fiscal válido no CNPJ, que pode ser o endereço residencial do titular ou outro endereço permitido pela legislação municipal, como por exemplo, um galpão onde armazena o material. O fato de a atividade não ser totalmente virtual não inviabiliza o cadastro.
O ponto de atenção é verificar as exigências do município quanto à inscrição municipal e ao alvará para a atividade de fabricação de esquadrias metálicas no endereço informado.
Espero ter ajudado.