Olá Patricia, tudo bem?
Sim, é possível ter CNAEs diferentes no mesmo CNPJ, desde que as atividades não tenham um impedimento por conselho de classe, o que, pelo que você mencionou, acredito que não seja o caso.
Nesse cenário, a prestação de serviços em TI pode permanecer como atividade principal, e a venda de produtos impressos em 3D pode ser incluída como atividade secundária. O principal ponto de atenção é garantir a coerência entre as atividades e avaliar os impactos tributários. Se uma atividade for considerada serviço e a outra comércio, é necessário fazer a apuração correta do que é serviço e do que é comércio.
Além disso, se não me engano, dependendo do CNAE, a atividade de TI pode estar sujeita ao Fator R, então esses pontos tributários também precisam ser avaliados.
Não vejo impedimento, mas vale analisar a parte fiscal.
Espero ter ajudado.