Olá Viviane, tudo bem?
Primeiramente, você precisa verificar qual o regime tributário dessa empresa.
Se o CNPJ do seu cliente não é optante pelo Simples Nacional, ele provavelmente está enquadrado em um dos outros regimes tributários, como o Lucro Presumido ou Lucro Real. Cada regime possui um método diferente para apuração e pagamento dos impostos.
Lucro Presumido:
IRPJ e CSLL: Apurados trimestralmente e pagos através do DARF (Documento de Arrecadação de Receitas Federais).
PIS e COFINS: Apurados mensalmente e pagos através do DARF.
ISS: Geralmente apurado e pago mensalmente na prefeitura do município onde a empresa está estabelecida.
ICMS: Se aplicável, apurado e pago mensalmente na Secretaria da Fazenda do estado (SEFAZ).
Lucro Real:
IRPJ e CSLL: Podem ser apurados trimestralmente ou mensalmente por estimativa através do fechamento do balanço, pagos através do DARF.
PIS e COFINS: Apurados mensalmente e pagos através do DARF.
ISS: Apurado e pago mensalmente na prefeitura do município onde a empresa está estabelecida.
ICMS: Se aplicável, apurado e pago mensalmente na SEFAZ do estado.
Os DARFs são gerados e pagos pelo site da Receita Federal (Sicalc Web), e os pagamentos de ISS e ICMS são feitos pelos respectivos sites das prefeituras e Secretarias da Fazenda estaduais.
Espero ter ajudado!