Olá Lusiane, tudo bem?
Em abril, não será possível aplicar o Fator R, pois o faturamento do mês é zero.
Já na apuração de maio, você vai usar o faturamento de maio e a folha de salários de abril para calcular o Fator R. Então, nessa apuração, sim, o Fator R será considerado, caso o faturamento e a folha de salários estejam dentro dos parâmetros necessários.
Porém, devido a complexidade do assunto, eu sugiro que assista nossa aula do curso de simples nacional, onde a professora explica melhor sobre o fator R e também na aula, tem uma planilha para você acompanhar e fazer o controle corretamente do seu cliente:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/236228-rotina-pratica-para-empresas-do-simples-nacional/4684018-fator-r
Espero ter ajudado!