Olá Luana, tudo bem?
Sim, uma empresa optante pelo Simples Nacional pode sim atuar tanto no comércio quanto na prestação de serviços sob o mesmo CNPJ. Para isso, basta que as atividades estejam devidamente cadastradas no CNPJ com os CNAEs corretos.
Na hora de calcular os impostos, as receitas de comércio é apurado pelo Anexo I e a prestação de serviços pode ser pelo Anexo III ou IV, dependendo do tipo de serviço.
Espero ter ajudado!