Quais Canais devo entrar para verificar se existe alguma pendência no CNPJ da empresa?

Olá Eduardo, tudo bem?

Você pode acessar o e-cac e gerar um relatório de pendência/situação fiscal, pode acessar também a sefaz do estado do seu cliente e também o site da prefeitura. Mas na sefaz e prefeitura, cada um terá sua particularidade de como consultar.

Nesses canais, federal, estadual e municipal, você conseguirá verificar quais pendências a empresa possui.

Espero ter ajudado!