Olá Thamires
A princípio, a operação pode funcionar em um único CNPJ e no mesmo espaço físico, reunindo clínica de estética, cursos e venda de produtos, desde que os CNAEs sejam compatíveis e todas as licenças necessárias sejam obtidas. Os principais pontos de atenção são as exigências da Vigilância Sanitária, do COREN e da prefeitura, além da necessidade de verificar se haverá obrigatoriedade de CNES, o que depende das atividades realizadas e das regras do município.
Pelo faturamento atual (cerca de R$ 8 mil por mês), o Simples Nacional tende a ser a melhor opção inicial. Quanto à natureza jurídica, a SLU costuma ser a escolha mais prática quando há apenas uma proprietária. O benefício de ISS fixo não depende de ser SLU ou LTDA, mas sim da legislação municipal e do enquadramento da atividade.
Se outros profissionais atuarem no local com seus próprios CNPJs, o ideal é formalizar contratos de locação ou cessão de espaço, deixando claras as responsabilidades de cada um. Como é sua primeira abertura, o mais importante é definir corretamente as atividades, CNAEs, licenças e contratos desde o início para evitar problemas futuros.
Espero ter ajudado.