Olá Ana
Sim, duas empresas podem ter o mesmo CNAE e funcionar no mesmo endereço, inclusive utilizando numerações distintas como nº 29 e nº 29B. No entanto, quando as empresas exercem a mesma atividade, pertencem a parentes e compartilham o mesmo espaço físico, a fiscalização pode verificar se existe efetiva autonomia entre elas ou se há uma divisão artificial da operação para obtenção de vantagens tributárias.
O principal risco ocorre se ambas funcionarem, na prática, como uma única empresa, compartilhando estoque, funcionários, equipamentos, clientes, administração financeira e gestão operacional. Nessa situação, a Receita Federal, o Estado ou o Município podem caracterizar unidade econômica ou simulação, gerando autuações, cobrança de tributos, multas e até desenquadramento de regimes favorecidos. O compartilhamento do endereço, por si só, não é proibido, mas é recomendável que cada empresa possua estrutura, controles, documentação e operação independentes. Além disso, é importante verificar se a atividade efetivamente exercida pelo MEI é permitida nesse regime, especialmente se houver participação em atividades de abate ou processamento de aves.
Portanto, a situação é possível legalmente, mas exige cuidados para demonstrar que os dois CNPJs são realmente independentes.
Espero ter ajudado.