Boa tarde, Rute
Tudo bem?
Para incluir mais CNAES vai depender do objeto social da Associação se ele for mais amplo (Ex. desenvolver atividades sociais, culturais, educacionais, assistenciais…), não precisaria altera o estatuto, seria só fazer o DBE incluindo os CNAES no CNPJ. Mas se os novos CNAES não estiverem compatíveis com o objeto atual, aí sim precisará alterar o estatuto.
Se precisar fazer alteração no estatuto, você não inclui CNAES no estatuto, mas coloca no objeto social as atividades a serem desenvolvidas pertinentes aos CNAES que quer colocar, minha sugestão que seja amplo para futuramente se precisar não ficar alterando o estatuto a todo momento.
Espero ter ajudado, e estou a disposição.