Olá Raul, tudo bem?
No MAT, o contador só consegue assinar quando o tipo de documento exige mais de uma assinatura e quando existe procuração válida na Receita Federal. Primeiro, o responsável legal (cliente) faz a assinatura. Depois disso, somente se o documento permitir outra assinatura é que o sistema libera a opção para o contador. Além disso, a cliente precisa ter outorgado procuração no e-CAC com poderes para assinatura de documentos ou Dossiê Digital, e o contador deve acessar com seu certificado ou pelo e-CAC usando essa procuração. Quando o documento exige apenas a assinatura do contribuinte ou já consta como assinado/concluído, a opção de assinatura para o contador não aparece.
Espero ter ajudado.