Boa tarde Pablo, tudo bem?
Você precisa verificar no e-cac a situação fiscal na Receita, para ver quais declarações podem estar pendentes, e demais órgãos como Prefeitura e Sefaz a depender da atividade dos seu cliente.
Pode haver outras pendências além da Receita Federal, é essencial verificar antes de efetuar a baixa.
Espero ter ajudado.