Olá Thamires
Sim, a empresa pode ter CNAE principal de vestuário e incluir CNAE secundário para venda de suplementos e encapsulados industrializados, algo comum no segmento fitness. O principal cuidado é verificar se será apenas revenda de produtos prontos ou manipulação própria, pois manipulação exige regras sanitárias e estrutura muito mais rigorosas.
Para suplementos, normalmente há exigência de licença da Vigilância Sanitária e atenção à procedência dos produtos e publicidade. No início, o Simples Nacional costuma ser a melhor opção por ter tributação mais simples e menor custo operacional.
Nas vendas presenciais usa-se NFC-e e nas vendas online ou para PJ, NF-e. Sistemas como Bling e Tiny costumam atender bem pequenos negócios.
No contrato social, o ideal é deixar o objeto social amplo, sem limitar apenas ao e-commerce, permitindo atuação tanto física quanto online.
Espero ter ajudado.
