Olá Silvia
O processo normalmente envolve uma alteração completa da natureza jurídica e do ato constitutivo. Como você já está providenciando a Ata e o Estatuto, o próximo fluxo será: realizar a assembleia/reunião formal aprovando a transformação, elaborar a Ata de Transformação com aprovação do Estatuto Social e eleição da diretoria, registrar esses documentos no Cartório de Registro Civil de Pessoas Jurídicas (RCPJ) e depois fazer a alteração cadastral na Receita Federal via DBE/REDESIM, alterando a natureza jurídica para associação privada (ou outra adequada).
Também será necessário atualizar CNAEs, quadro societário/administradores, endereço e demais dados cadastrais. Após a alteração do CNPJ, é importante verificar os reflexos tributários e cadastrais, pois a entidade deixará de seguir regras de empresa comum e passará a ter obrigações específicas de entidades sem fins lucrativos.
Além disso, “sem fins lucrativos” não significa automaticamente isenção de tributos, então o estatuto deve estar adequado ao art. 14 do CTN caso futuramente busquem imunidade ou isenção tributária.
Espero ter ajudado.