@Thamires Essa escolha varia de caso a caso. Não consigo te dizer se a opção A ou B é melhor, sem conhecer a fundo.
É interessante buscar o máximo de informações possíveis do cliente, previsão de faturamento, perspectivas, ideias, atividades a serem exercidas… A natureza jurídica, é apenas um dos pontos que vão ser decididos.
Por exemplo: Se você faz o planejamento tributário de um cliente, e verifica que ele pode ser MEI, dessa forma ele seria Empresário Individual, já que é proibido ter outra natureza jurídica.
Ou seja, um ponto vai ser determinante para o outro, compreende?
Se você quiser, temos um curso chamado trilhas de carreira, onde ajuda a ter uma base para quem está começando.
Segue o link do módulo mencionado:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/119045-trilhas-de-estudo