Olá Raiane
Sim, você pode usar assinatura digital gov.br para contratos/atos no Redesim/Jucesp. Pode assinar à distância (cliente em outra cidade), basta baixar os documentos, enviar ao cliente, ele assinar digitalmente e você submeter ao registro.
Só é necessário garantir que o certificado digital do cliente atenda os requisitos da Jucesp.
Espero ter ajudado.