Olá Karine, tudo bem?
De modo geral, você precisa fazer um levantamento detalhado dos valores envolvidos: o saldo da conta de imóvel no ativo atual, a depreciação acumulada até a data da venda e o valor da venda realizada.
Depois, deverá realizar o ajuste no Patrimônio Líquido para refletir o resultado dessa operação, dando baixa no imóvel e na depreciação acumulada e a contrapartida vai ser a conta: ajuste de exercício anteriores.
Lembre-se de que, dependendo da diferença entre o valor contábil líquido (imóvel menos depreciação) e o valor da venda, pode haver um ganho ou perda que impactaria o resultado da empresa e pagamentos de impostos (se for esse o caso, avaliaria abrir a contabilidade anterior para a devida correção e contabilização).
Espero ter ajudado!