Olá Ivan, tudo bem?
A rotina contábil, de forma geral, continuará a mesma. Umas das principais diferenças é que, por se tratar de empresa de comércio, você passará a trabalhar com estoque de mercadorias, o que não ocorre nas empresas exclusivamente prestadoras de serviço.
Seu cliente precisará controla o estoque, e você por sua vez solicitar mensalmente ao cliente a posição do estoque, para que seja possível calcular corretamente o CMV (Custo da Mercadoria Vendida) e lançar na contabilidade.
Além disso, dependendo do porte da operação, pode haver uma folha de pagamento maior, com outras verbas trabalhistas (como adicionais, horas extras, comissões, etc.), o que também exige um pouco mais de atenção na contabilização.
Espero ter ajudado.