Olá, boa noite!
É necessário utilizar contas de estoque e contas de transferência no Ativo/Passivo. A transferência não deve ser contabilizada diretamente na conta de custo (DRE), pois ainda não ocorreu a venda a terceiros, apenas a movimentação física.
Na Matriz (Remetente):
D - Transferências entre Estabelecimentos (Ativo Circulante - Conta Transitória)
C - Estoque de Mercadorias (Ativo Circulante)
Na Filial (Destinatária):
D - Estoque de Mercadorias (Ativo Circulante)
C - Transferências entre Estabelecimentos (Passivo Circulante - Conta Transitória).
O saldo credor na matriz deve ser exatamente igual ao saldo devedor na filial (e vice-versa). No Balancete Consolidado: Ao unir os balancetes da matriz e filial, a conta devedora de uma elimina a credora da outra. Portanto, o saldo final na consolidação deve ser zero.
Espero ter ajudado.